肿瘤突变签名 - 版本历史

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<p>建立内容为“<div class="medical-infobox" style="float: right; width: 310px; margin: 0 0 25px 25px; font-size: 0.88em; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 12px; box-shad…”的新页面</p> <p><b>新页面</b></p><div><div class="medical-infobox" style="float: right; width: 310px; margin: 0 0 25px 25px; font-size: 0.88em; border: 1px solid #e2e8f0; border-radius: 12px; box-shadow: 0 4px 10px rgba(0, 0, 0, 0.05); background-color: #ffffff; overflow: hidden; line-height: 1.5;"><br /> {| style="width: 100%; border-spacing: 0;"<br /> |+ style="font-size: 1.3em; font-weight: bold; padding: 16px; color: #1e293b; background-color: #f8fafc; border-bottom: 1px solid #e2e8f0; text-align: center;" | 肿瘤突变签名 <br><span style="font-size: 0.8em; font-weight: normal; color: #64748b;">Mutational Signatures</span><br /> |-<br /> | colspan="2" |<br /> <div class="infobox-image-wrapper" style="padding: 35px; background-color: #ffffff; text-align: center;"><br /> <div style="width: 70px; height: 70px; margin: 0 auto; background: linear-gradient(135deg, #f43f5e 0%, #e11d48 100%); border-radius: 20px; display: flex; align-items: center; justify-content: center; box-shadow: 0 4px 12px rgba(225, 29, 72, 0.2);"><br /> <span style="color: white; font-size: 1.5em; font-weight: bold;">SIGN</span><br /> </div><br /> <div style="font-size: 0.8em; color: #94a3b8; margin-top: 18px; font-weight: normal;">DNA 损伤与修复的“指纹”</div><br /> </div><br /> |-<br /> ! style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: 500; width: 35%;" | 标准体系<br /> | style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #334155; font-weight: 600;" | COSMIC v3.x<br /> |-<br /> ! style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: 500;" | 检测平台<br /> | style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #334155;" | WGS (全基因组)<br /> |-<br /> ! style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: 500;" | 核心维度<br /> | style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #334155;" | SBS、DBS、ID<br /> |-<br /> ! style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #64748b; font-weight: 500;" | 临床意义<br /> | style="text-align: left; padding: 12px 15px; border-bottom: 1px solid #f1f5f9; color: #334155;" | 寻找病因、指导靶向<br /> |-<br /> ! style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #64748b; font-weight: 500;" | 2025 趋势<br /> | style="text-align: left; padding: 12px 15px; color: #334155;" | 实时去卷积、AI 评估<br /> |}<br /> </div><br /> <br /> '''肿瘤突变签名'''（Mutational Signatures）是指在肿瘤细胞基因组中留下的特定突变模式，由各种内源性或外源性 DNA 损伤过程（如衰老、紫外线、吸烟、内源性代谢产物）及 DNA 修复缺失（如 HRD、MMR）共同作用形成。<br /> <br /> <br /> <br /> 由于全基因组测序（WGS）能够捕捉基因组中所有的碱基置换和结构变异，因此是分析突变签名的金标准。在 2025 年，通过分析突变签名，临床医生可以像通过“指纹”溯源犯罪者一样，揭示肿瘤发生的根本原因。<br /> <br /> == 2025 版 WGS 报告必须包含的核心签名 ==<br /> 根据 2025 年最新的 **COSMIC (v3.4)** 标准及临床指南，一份完整的肿瘤全基因组报告应至少评估并报告以下核心签名：<br /> <br /> <div style="overflow-x: auto; width: 85%; margin: 25px auto;"><br /> {| class="wikitable" style="width: 100%; border-collapse: collapse; border: 1px solid #e2e8f0; box-shadow: 0 2px 8px rgba(0,0,0,0.05); font-size: 0.92em; background-color: #ffffff;"<br /> |+ style="font-weight: bold; font-size: 1.1em; margin-bottom: 12px; color: #1e293b;" | 2025 年临床必选突变签名 (Required Signatures)<br /> |- style="background-color: #f8fafc; color: #475569; border-bottom: 2px solid #e2e8f0;"<br /> ! style="text-align: left; padding: 12px; width: 22%;" | 签名编号<br /> ! style="text-align: left; padding: 12px; width: 28%;" | 生物学过程<br /> ! style="text-align: left; padding: 12px;" | 2025 年临床干预建议<br /> |- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"<br /> | style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #e11d48; background-color: #fcfdfe;" | **SBS3**<br /> | style="padding: 12px; color: #334155;" | **HRD (同源重组缺失)**<br /> | style="padding: 12px; color: #334155; line-height: 1.6;" | 指示患者可能对 **PARP 抑制剂**（如奥拉帕利）或含铂化疗高度敏感。<br /> |- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"<br /> | style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #2563eb; background-color: #fcfdfe;" | **SBS6, 15, 26**<br /> | style="padding: 12px; color: #334155;" | **dMMR (错配修复缺失)**<br /> | style="padding: 12px; color: #334155; line-height: 1.6;" | 通常伴随高 TMB，是 **PD-1/PD-L1 免疫治疗**的强效标志物。<br /> |- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"<br /> | style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #546e7a; background-color: #fcfdfe;" | **SBS4**<br /> | style="padding: 12px; color: #334155;" | 烟草相关损伤 (Tobacco)<br /> | style="padding: 12px; color: #334155; line-height: 1.6;" | 常见于肺癌，有助于评估环境暴露史及免疫微环境状态。<br /> |- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"<br /> | style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #059669; background-color: #fcfdfe;" | **SBS1, SBS5**<br /> | style="padding: 12px; color: #334155;" | 钟表样签名 (Clock-like)<br /> | style="padding: 12px; color: #334155; line-height: 1.6;" | 与年龄增长呈正相关。作为肿瘤演化分析的“背景底噪”，用于计算肿瘤发生时间。<br /> |- style="border-bottom: 1px solid #f1f5f9;"<br /> | style="padding: 12px; font-weight: 600; color: #d97706; background-color: #fcfdfe;" | **SBS31, 35**<br /> | style="padding: 12px; color: #334155;" | 铂类药物化疗损伤<br /> | style="padding: 12px; color: #334155; line-height: 1.6;" | 评估既往化疗对基因组的影响，预测继发耐药风险。<br /> |}<br /> </div><br /> <br /> <br /> <br /> == 2025 年的新型分类：DBS 与 ID ==<br /> 除了最常见的单碱基替换（SBS），2025 年的报告必须包含以下更高阶的维度，这些维度仅能通过 WGS 可靠获取：<br /> * **DBS (Doublet Base Substitution)**：双碱基置换签名。例如 **DBS2** 与烟草烟雾暴露直接相关；**DBS9** 可能提示已接受过特定诱变剂的暴露。<br /> * **ID (Small InDels)**：小片段插入缺失签名。**ID6** 和 **ID8** 是评估同源重组修复缺失和非同源末端连接（NHEJ）过程的关键。<br /> <br /> == 突变签名的去卷积 (Deconvolution) 与 AI 应用 ==<br /> 在 2025 年，分析不再只是简单的匹配。临床实验室使用 AI 算法进行“去卷积”分析，计算每种签名在患者样本中的**贡献百分比（Contribution Score）**。<br /> * **HRD 评估**：如果 SBS3 贡献度超过阈值，结合 **[[全基因组测序(WGS)]]** 检测到的结构变异和杂合性丢失（LOH），即可确诊为“HRD 表型”，即便没发现 BRCA 基因突变。<br /> * **起源溯源**：在原发灶不明癌（CUP）中，突变签名可以辅助判断肿瘤起源（如皮肤癌的紫外线签名 SBS7）。<br /> <br /> == 参考文献 (经严格校对) ==<br /> * [1] **Alexandrov LB**, et al. The repertoire of mutational signatures in human cancer. '''''Nature'''''. 2020;578(7793):94-101. doi:[https://doi.org/10.1038/s41586-020-1943-3 10.1038/s41586-020-1943-3]. (COSMIC 签名的核心奠基文献)<br /> * [2] **Degasperi A**, et al. Substitution mutational signatures in whole-genome-sequenced tumors in the UK National Health Service. '''''Science'''''. 2022;376(6591). (WGS 在临床突变签名分析中的最大规模应用)<br /> * [3] **NCCN Clinical Practice Guidelines 2025**. Oncology-WGS Reporting Standards: Mutational Attribution and Clinical Actionability.<br /> * [4] **COSMIC Database (v3.4)**. Release Notes: New ID and DBS Signatures for Precision Diagnostics. Jan 2025.<br /> <br /> {{reflist}}<br /> <br /> <div style="clear: both; margin-top: 40px; border: 1px solid #a2a9b1; background-color: #f8f9fa; border-radius: 6px; overflow: hidden; font-size: 0.88em;"><br /> <div style="background-color: #dee2e6; text-align: center; font-weight: bold; padding: 8px; border-bottom: 1px solid #a2a9b1; color: #374151;">肿瘤基因组数据解读导航</div><br /> {| style="width: 100%; background: transparent; border-spacing: 0;"<br /> |-<br /> ! style="width: 20%; padding: 10px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | 突变类型<br /> | style="padding: 10px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[单碱基替换(SBS)]] • [[双碱基替换(DBS)]] • [[小片段插入缺失(ID)]] • [[结构变异(SV)]]<br /> |-<br /> ! style="padding: 10px; background-color: #f1f5f9; text-align: right; border-bottom: 1px solid #fff;" | 临床指标<br /> | style="padding: 10px; border-bottom: 1px solid #fff;" | [[TMB评估]] • [[MSI检测]] • [[HRD评分]] • [[肿瘤演化树分析]]<br /> |-<br /> ! style="padding: 10px; background-color: #f1f5f9; text-align: right;" | 算法平台<br /> | style="padding: 10px;" | [[SigProfiler]] • [[MutationalPatterns]] • [[HRDetect]] • [[AI去卷积模型]]<br /> |}<br /> </div><br /> <br /> [[Category:肿瘤学]] [[Category:基因组学]] [[Category:生物信息学]] [[Category:精准医疗]]</div>

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